Rusa Jawa berwarna coklat kehitaman gelap dan mempunyai dahi kelabu. Punggungnya hampir hitam, bahagian bawah dan paha dalam berwarna coklat kekuningan. Perut berwarna coklat muda, dan jumbai ekor berwarna coklat kehitaman gelap. Rambutnya kasar dan lebih panjang di bahagian dada berbanding bahagian badan yang tinggal. Telinganya lebar dan pendek sedikit daripada kepalanya. Tanduk adalah sederhana panjang dan agak lebar, cawangan atas menghala ke hadapan.[3] Anak rusa dilahirkan tanpa bintik. Rusa jantan lebih besar daripada betina; panjang kepala ke badan adalah dari 142 hingga 185 cm (4.66 hingga 6.07 ka), dengan 20 cm (7.9 in) ekor. Rusa jantan memiliki berat 152–160 kg (335–353 lb), dan rusa betina adalah kira-kira 74 kg (163 lb).[4]